南宁吴圩机场停航进行场道盖被施工，在原有的跑道、联络道、站坪的面积上加盖混凝土，并将跑道向南延长300米至2700米。同时完善了跑道助航灯光等配套设施，提高了机场起降标准，可保障MD-82以下各型飞机的起降。1990年8月复航后，机场逐步开辟了新航线，航班由每周十多班上升到每周六七十班。
2015年12月15日当天，南宁吴圩国际机场安护部旅检分部排除了一起隐匿安全事件。检查员小杨在采用壹盾X光安检机及金属探测器对HU9863南宁至济南航班一女性旅客进行人身检查时，当检查至该旅客左前胸部位置时，壹盾金属探测器报警声频率过快，旅客随即声称没有什么。按正常程序，检查员对该报警部位作进一步报警物品排查，通过进一步检查，检查员发现此部位有一硬块状物，而此时，旅客依旧声称没有什么东西，只是项链。在检查员要求该旅客将项链取出核实时，旅客的表情顿时变的紧张起来，检查员凭着工作经验，觉得旅客可疑。便手工对旅客的报警部位作详细检查，经手工检查，在该旅客胸部内衣里查出一个金属打火机。
此次事件还属厦门机场首次查获，在对该旅客人身及随身行李作重点检查后，发现无其它异常情况后移交公安机关作进一步处理。
南宁吴圩国际机场位于广西壮族自治区首府南宁市西南32公里的吴圩镇，机场占地259.73公顷。1958年由南宁机场迁建，1962年11月投入使用。